吉林省吉林市昌邑区孤店子镇行政区划上隶属于昌邑区，昌邑区隶属于孤店子镇，孤店子镇隶属于吉林市，吉林省吉林市昌邑区孤店子镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于吉林市。