巴音查岗苏木莫赫尔图嘎查行政区划上隶属于鄂温克族自治旗，鄂温克族自治旗隶属于呼伦贝尔市，呼伦贝尔市隶属于内蒙古自治区，巴音查岗苏木莫赫尔图嘎查的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。