土城子镇巴嘎淖尔村行政区划上隶属于内蒙古自治区通辽市奈曼旗，土城子镇巴嘎淖尔村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区通辽市奈曼旗。