科克浩特浩尔托普村行政区划上隶属于尼勒克县，尼勒克县隶属于伊犁哈萨克自治州，科克浩特浩尔托普村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于伊犁哈萨克自治州。