淖毛湖镇行政区划上隶属于伊吾县，伊吾县隶属于哈密地区，哈密地区隶属于新疆维吾尔自治区，淖毛湖镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。