马奈乡耿扎村行政区划上隶属于四川省阿坝藏族羌族自治州金川县，马奈乡耿扎村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于四川省阿坝藏族羌族自治州金川县。