甘肃省甘南藏族自治州合作市行政区划上隶属于甘南藏族自治州，甘南藏族自治州隶属于合作市，合作市隶属于甘肃省，甘肃省甘南藏族自治州合作市的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于甘肃省。